監督の行動ポイントは原則３ポイントとありますが
どこかで確認できるのでしょうか？

また、

[トレーニング]
巧打

[特訓]
選手Ａ
選手Ｂ
選手Ｃ

と、仮登録しても、エラーのようなメッセージが表示されません。
監督ポイントが４必要という認識ですが、
チームポイントが消費されているのでしょうか？

その記述ですと、チーム保有ポイントが100ポイント消費されます。
　
「チーム運営画面」のチェック機能ですが、実は不完全です。
おそらく「監督の行動ポイント」に関しては何もチェックされていません。
ですので、使い残しの場合にもエラーメッセージが出ないはずです。
　
他に少なくとも
・「監督の能力」の「上昇ポイント」の振り残し（なお、多い場合はメッセージが出ます）
・「新人の上昇ポイント」を球速の制限を超えて振ってしまった場合
・新人選手を元の能力より低いパラメータで、登録を出してしまった場合
このあたりも何もエラーが出ないはずですので、ご注意ください。
　
☆余談ですが、歴史的な（？）いきさつを。
　
元々、登録用紙は「チーム運営画面」のようなCGI画面ではなく、
メールで送信するもので、チェック機能自体がありませんでした。
「チーム運営画面」はあとから追加されたもののため、先代のコミッショナーの時代から
チェック機能が不完全なままになっていたりします。
いまのところ、補助機能くらいに思っていていいかもしれません。
　
なお、実際の登録実行をするプログラムのほうでは厳密にチェックされています。

なるほど！
大変参考になりました！
ありがとうございます。